Qu'est-ce que la reproductibilité ?
- La définition du concept de reproductibilité paraît simple puisqu’il s’agit, pour un observateur extérieur, de s’assurer qu’une analyse et ses résultats mobilisant des données et leur traitement puissent être reproduits parfaitement, à l’identique
- Ecouter/Voir la présentation Le pourquoi et le comment de la recherche reproductible par Konrad Hinsen (Centre de Biophysique Moléculaire, UPR 4301 CNRS) à une séance proposée par le service des méthodes statistiques aux Lundis de l'Ined
Pourquoi adopter une démarche reproductible ?
- Pour corriger ou actualiser facilement son travail, en conservant dès le départ la trace des raisonnements, des données, des codes, des références…
- Pour attester plus facilement les résultats obtenus devants les pairs, pour répondre plus facilement aux questions des évaluateurs, pour satisfaire les revues qui demandent le partage des données et des codes, voire exigent des certificats de reproductibilité
- Pour avoir des pratiques conformes aux exigences de l’intégrité et de la déontologie des métiers de la recherche
Comment faire ?
Documenter toutes les étapes de sa démarche scientifique notamment les méthodes employées, conditions et instructions.
- Les cahiers de laboratoires ou Electronic Laboratory Notebook permettent de recueillir et centraliser toutes les informations essentielles à la reproduction d’une expérience scientifique
- Ecouter/ Voir Introduction à R pour la mise en oeuvre de chaines de traitements reproductibles par Hugues Pecout (CIST) et Ronan Ysebaert (UMS Riate, CNRS) au séminaire R à l’Usage des Sciences Sociales
Certifier la reproductibilité
CASCaD (Certification Agency for Scientific Code and Data) est un laboratoire public spécialisé dans la certification de la reproductibilité de la recherche scientifique.
Cette certification garantit que les résultats numériques (tableaux et figures) présentés dans une publication scientifique (document de travail, article publié et rapport) sont reproductibles en utilisant un ensemble identifiable de ressources numériques (code et/ou données) mises à disposition par les auteurs de cette publication.
Cascad et le CASD proposent en partenariat une solution pour attester de la reproductibilité d'une recherche sur des données confidentielles (voir ici).
